早孕期流产是孕妇妊娠失败的重要原因。辅助生殖技术中10-15%的胚胎会在妊娠早期发生自然流产。50%的早孕期流产与胎儿染色体异常有关。这些染色体异常包括常染色体三体、多倍体、X染色体单体及染色体嵌合体等。不平衡罗伯逊易位、染色体相互易位则被报道与2-5%的反复流产有关。对流产组织进行检测，查找患者流产原因，对于帮助患者消除疑虑、指导第二胎妊娠大有帮助。

 

    在过去30年，核型分析一直是检测流产组织染色体异常的首选技术。随后FISH、QF-PCR、MLPA、Array CGH和SNP array等技术也越来越多的被用于查找流产原因。近几年，高通量测序技术（NGS）被应用于临床，贝瑞和康与中南大学医学遗传学国家重点实验室合作开发的拷贝数变异测序（CNV-Seq）也被用于染色体拷贝数的检测，帮助查找流产原因。 

 

    CNV-Seq检测染色体微缺失微重复具有很高的检测精度。在已发表的文献中，CNV-Seq被报道具有良好的特异性及可重复性，检测分辨率约为0.1Mb。近期贝瑞和康与南方医科大学南方医院合作在《Ultrasound in Obstetrics & Gynecology》 上发表题为“Traditional karyotyping vs copy number variation sequencing for detection of chromosomal abnormalities associated with spontaneous miscarriage”的文章，与大家分享了CNV-Seq在检测与自发流产相关的染色体异常方面的效能。

 

    64例流产组织样本用于CNV-Seq检测，包含16例核型分析检测异常的样本和48例核型分析检测正常的样本。CNV-Seq检测出了16例核型分析异常样本中的15例，检测符合率达95%，另1例经STR分析确认为69,XXX的多倍体样本由于自身常染色体与性染色体的比率等同于46,XX，而被CNV-Seq漏检。对于剩余的48例核型分析检测正常的样本，CNV-Seq检测出1例样本在22q区段缺失2.58Mb，与DiGeorge综合征相关，另有9例样本存在无临床意义的微小CNVs。虽然目前尚无明确的临床数据表明哪种染色体CNVs会直接导致胎儿流产，但DiGeorge综合征作为一种研究较为清晰、临床意义明确且严重的染色体疾病，很大可能会造成胎儿的死亡和流产，即使活产，患儿也会表现为先天性心脏病、上颚、胃肠、泌尿生殖系统发育异常、免疫缺陷、内分泌紊乱、发育迟滞、认知障碍、精神疾病等临床表型。

 

     该文章的研究结果表明，CNV-Seq对于与自发流产相关的染色体异常检测能达到很高的检出率，若与STR分析同时运用，未来可作为核型分析的替代技术加以运用。另外文章作者又分别将CNV-Seq与核型分析和芯片技术进行了比较。CNV-Seq与核型分析相比具有检测时间短、可检测嵌合体以及检测所需样本量低等优势。不过由于核型分析的价格较低，在一段时间内，核型分析仍然是检测的金标准。至于芯片技术，CNV-Seq也具有对嵌合体检测灵敏度更高、特异性更好、实验流程更简单更快速、通量更灵活、检测成本更低等优势。

 

 

参考文献

1. Liang, D., Peng, Y., Lv, W., Deng, L., Zhang, Y., Li, H., Yang, P., Zhang, J., Song, Z., Xu, G., Cram, D.S., Wu, L., 2014. Copy number variation sequencing for comprehensive diagnosis of chromosome disease syndromes. The Journal of molecular diagnostics : JMD 16, 519-526.

2. S. Liu, L. Song, D. S. Cram, L. Xiong, K. Wang, R. Wu, J. Liu, K. Deng, B. JiaI,M. Zhong and F. Yang. Traditional karyotyping vs copy number variation sequencing for detection of chromosomal abnormalities associated with spontaneous miscarriage. Ultrasound Obstet Gynecol 2015;46:472-477.